O tratamento da doença diverticular dos cólons só é realizado se estiver com diverticulite, que é a base de antibiótico e mesalazina. Se houver sangramento, pode ser necessário a realização de videocolonoscopia para tratamento. Se ocorrerem crises próximas de diverticulite, num valor de 3 crises, o mais indicado é o tratamento cirúrgico.
A dieta é realizada quando tem diverticulite. Antigamente suspendia-se grãos, caroços da alimentação.
Deve-se evitar uso de anti-inflamatórios, que contribuem para desencadear a diverticulite e até sangramentos.

O clostridium difficile, é feito com metronidazol. Porém, alguns casos são de difícil tratamento. Em determinados casos, pode ser realizado com vancomicina.

A doença inflamatória intestinal, doença de Chron e Retocolite Ulcerativa são acompanhadas e tratadas clinicamente pela gastroenterologia. A abordagem cirúrgica é realizada pela proctologia, mas alguns especialistas dessa área, também, são preparados para acompanhamento clínico.